| Версія | 7.3 |
|---|---|
| Видавництво | Scalable Computing Laboratory |
| Дата випуску | 28 трав. 2009 р. |
| Дату додано | 28 трав. 2009 р. |
| Вимоги ОС | Mac OS X 10.3.9/10.4 Intel/10.4 PPC/10.5 Intel/10.5 PPC |
| Вимоги | None |
| Загальна кількість завантажень | 864 |
| Завантаження на тиждень | 1 |
| Ціна | Free |
Опис
MacMolPlt — це інструмент візуалізації хімії, який можна використовувати для побудови молекул за допомогою інтегрованого графічного конструктора моделей, створення вхідних файлів для програми обчислювальної хімії GAMESS, а потім візуалізації результатів циклів обчислювальної хімії. Функції включають високоякісний 3D-дисплей, анімацію звичайних режимів і послідовності реакцій, а також вихід у різноманітні формати, включаючи високоякісні зображення та відео QuickTime і Flash.
Введення з використанням: Формат файлу MolPlt, вибитий GAMESS шляхом вставки в декартові координати з будь-якого файлу журналу GAMESS або Гауса, будь-який файл входу GAMESS, журнал або irc Файл у стилі Xmol XYZ Файли у форматі MolDen Файл банку даних білка (pdb) Мова хімічної розмітки (CML) файли Створюйте графічно за допомогою інтерактивного редактора молекул Створюйте вручну за допомогою внутрішніх координат у стилі декартової системи чи Z-матриці Тривимірне відображення структури та звичайний режим Анімація звичайних режимів. Тривимірне обертання та трансляція в режимі реального часу під керуванням миші. Обчислення будь-якого параметра Z-матриці. Візуальне вимірювання/відображення відстаней, кутів і двогранників. Автоматизоване створення шляхів лінійного найменшого руху (LLM) 2D і 3D обчислення та відображення: молекулярних орбіталей (AO, MO або LMO) повної електронної щільності різниці щільності молекулярних електростатичних потенціалів (MEPMaps) базового генератора вхідних файлів для GAMESS OpenGL, що використовується для високоякісних якісна 3D-візуалізація Підтримка молекулярної симетрії Створення залежних від симетрії атомів Визначення унікальних атомів симетрії Автоматичне визначення списку підтримуваних груп точок для набору координат. Повертайте координати в правильну принципову орієнтацію. Відображайте оператори симетрії для багатьох груп точок. Якісний вихід публікації (кольоровий або чорно-білий) через прямий друк або копіювання та вставлення в іншу програму. Вихід у різноманітних формах, включаючи растрове зображення Windows, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies і QuickTime.
