POY

Опис

POY — це програма філогенетичного аналізу, яка підтримує численні типи даних (наприклад, морфологію, нуклеотиди, гени та генні області, хромосоми та цілі геноми). Особливістю POY є те, що він може виконувати справжнє вирівнювання та філогенічний висновок, тобто вхідні послідовності не потрібно попередньо вирівнювати. Вставки, видалення та перегрупування можна потім включити в загальну оцінку дерева в розділі «Максимальна економність» або в модель в розділі «Максимальна ймовірність». Для цього було розроблено різноманітні евристичні алгоритми, які реалізовані в POY.