GATE

Опис

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) — інтегрована обчислювальна програмна платформа для аналізу та візуалізації високовимірних біомолекулярних часових рядів. GATE використовує алгоритм кластеризації на основі кореляції для впорядкування молекулярних часових рядів у двовимірному гексагональному масиві та динамічного фарбування окремих шестикутників відповідно до рівня експресії молекулярного компонента, якому вони призначені, для створення анімаційних фільмів молекулярного рівня на системному рівні. нормативна динаміка. Щоб зробити висновок про потенційні механізми регулятивного контролю на основі моделей кореляції, GATE також дозволяє інтерактивно опитувати фільми щодо широкого спектру попередніх наборів даних. Фільми GATE можуть бути призупинені та інтерактивні, дозволяючи користувачам реконструювати мережі та виконувати функціональний аналіз збагачення. Фільми, створені за допомогою GATE, можна зберегти у форматі Flash і вставити безпосередньо у файли рукописів PDF як інтерактивні малюнки.