MD simulation for iPhone

Опис

Ульсанський університет, Школа машинобудування, лабораторія MNTF (мікро/наномасштабна термофлюїдна інженерія). http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/Будь ласка, дотримуйтеся наведених нижче посібників для кількох прикладів випадків. Усі наведені нижче приклади передбачають початкові стани після екрана завантаження. (відкоригуйте Dt, щоб побачити результат швидше. Також спробуйте ті, що мають [WCA] та [Ideal]) 1. Симуляція потоку Куетта [Пуск] - зачекайте, поки система досягне рівноваги- [Куетт] - зачекайте, поки система досягне рівня стаціонарний стан (профілі миттєвої швидкості доступні в сірому полі праворуч унизу) 2. Моделювання потоку Пуазейля [Початок] - зачекайте, поки система досягне рівноваги - [Пуазейль] - зачекайте, поки система досягне стаціонарного стану 3. Дифузія моделювання [Init3,4,5] - встановити цільову температуру близько 250~350K - [початок] 4. Моделювання заморожування та кристалізації [Init3,4,5] - встановити цільову температуру нижче 80K - [початок] 5. Більше порад! Кнопка [Пуск] встановлює розподіл швидкості Максвелла-Больцмана для кожної молекули рідини. ! [L-J] — це потенціал VDW на основі молекулярного параметра аргону, [WCA] — це чисто відштовхувальна міжмолекулярна взаємодія, а [Ideal] нехтує розміром молекул і зіткненнями, як передбачає закон ідеального газу. ! Ви можете збільшити крок за часом (Dt), щоб зробити моделювання швидшим, але це може призвести до збою моделювання та скидання. ! Коли моделювання скидається, цільова температура та крок часу (Dt) встановлюються на найнижче можливе значення. ! Ви можете змінювати цільову температуру під час симуляції та регулювати поточну температуру за допомогою термостата. ! Ви можете почати моделювання в різних початкових умовах за допомогою кнопки [Init]! Кнопка [T/Tt] встановлює термостат на систему з цільовою температурою. «ЧЕРВОНА» мітка означає термостат із шкалою швидкості, а «помаранчева» мітка означає термостат Nose-Hoover. ***Molecular Dynamics in iPhone Argon Fluid in 5nm Channel За останні два десятиліття революційний прогрес високопродуктивних обчислювальних ресурсів привів до досліджень молекулярної динаміки (MD) моделювання атомістичного рівня в персональних настільних комп’ютерах. Зараз я розширюю платформи MD на доступні потужні мобільні комп’ютерні пристрої (iPhone), і це може бути перша спроба в історії MD. Потоки рідини в мікронних і нанорозмірних областях часто зустрічаються в компонентах мікроелектромеханічних систем, мікрофлюїдних пристроїв і жорстких дисків комп’ютерів. Наприклад, для жорстких дисків відстань між головкою та носієм становить десятки нанометрів. Потік рідини в таких малих масштабах неможливо описати за допомогою гіпотези континууму. Молекулярна динаміка потенційно може вирішувати такі проблеми, як межі/взаємодії між твердою та рідиною, що виникають у нанорозмірному режимі. Крім того, великомасштабне моделювання на основі атомістичних моделей також може стосуватися переходу від атомістичного підходу до безперервного масштабу. Це код молекулярної динаміки (MD) (i2DMD), який працює на iPhone. Цей код містить більшість функцій (але спрощених для візуалізації та освітніх цілей) фактичного коду MD, який використовувався для моїх публікацій у журналах SCI, перелічених у інформаційному посиланні. Ви можете імітувати потік Куетта, потік Пуазейля, дифузію та замерзання аргону в 5-нм каналі з періодичними граничними умовами. Я сподіваюся, що цей зразок коду допоможе людям зрозуміти нанорозмірну молекулу