RightField

Опис

RightField може вказати діапазон дозволених термінів із вибраної онтології (підкласи, особи чи комбінації) для кожного поля анотації. Отримана електронна таблиця представляє ці терміни користувачам у вигляді простого розкривного списку. Це зменшує бар’єр прийняття для використання онтологій спільноти, оскільки анотація робиться науковцем, який створив дані, а не третьою стороною, і анотація збирається під час збору даних.

RightField — це окрема програма Java, яка використовує Apache-POI для взаємодії з документами Microsoft. Це дозволяє користувачам імпортувати електронні таблиці Excel або створювати нові з нуля. Онтології можна імпортувати з локальних файлових систем або зі сховища онтологій BioPortal. Окремі клітинки, цілі стовпці чи рядки можна позначити необхідними діапазонами термінів онтології, а окрему електронну таблицю можна анотувати термінами з кількох онтологій.

Після розмітки та збереження електронна таблиця з підтримкою RightField містить «приховані» аркуші з інформацією про походження та версії онтологій, які використовуються в анотації. Ця інформація про походження є важливою у разі майбутніх змін онтології, які можуть призвести до втрати вже вибраних значень або можуть додати більш детальні параметри та запропонувати повторну анотацію. RightField призначений як інструмент адміністратора. Він доповнює електронні таблиці, які вже можуть відповідати конкретним шаблонам, для подальшої стандартизації термінології.