MultiGeneBlast

Опис

MultiGeneBlast — це інструмент із відкритим вихідним кодом, заснований на переформатуванні заголовків FASTA білкових записів NCBI GenBank, за допомогою якого можна відстежувати їхні вихідні нуклеотиди та координати. MultiGeneBlast може допомогти у виявленні таких мультигенних частин для проектів синтетичної біології. Синтетичну бібліотеку оперонів можна створити на основі її виходу, щоб ідентифікувати ті оперони, чия функція є найближчою до бажаної користувачем. Цей інструмент надає можливість ідентифікувати всі гомологічні геномні області шляхом об’єднання результатів окремих прогонів BlastP для кожного гена та сортування геномних областей із будь-якого запису GenBank за кількістю звернень, збереженням синтенії та кумулятивним бітовим показником Blast. Пошук архітектури можна виконати, щоб знайти будь-які геномні області з ударами Blast до будь-якої комбінації амінокислотних послідовностей, визначених користувачем.