GelApp for iPhone

Опис

опис

Це програма, яка дозволяє аналізувати смуги гелю (як агарози, так і PAGE) із зображень із логарифмічним графіком, автоматично створеним із маркерів. Це дозволяє автоматично виявляти та завантажувати для подальшого використання. Використовуючи фільтр Габора, ця програма дозволяє користувачам покращувати автоматичне визначення смуг. Для зображень низької якості користувачі можуть клацнути вручну намалювати рамку на потрібній смузі або клацнути зображення, щоб визначити вказане місце.

Зображення можна завантажувати з галереї або Dropbox, що робить це дуже зручним. Найкращі зображення – це ті, які створюються за допомогою сканерів, але вони працюватимуть із добре зробленими фотографіями з мобільних камер.

Фотографії повинні бути зроблені на прямій площині з гелем.

Особливості цієї програми включають:

1) Специфікація агарози або PAGE.

2) Ідентифікація кольорів маркерних смуг для PAGE.

3) Розширені фільтри зображень - Gabor.

4) Автоматизована обробка зображень із настроюваним введенням користувача, якщо необхідно.

5) Збереження налаштувань обробки зображень для подальшої зручності.

6) Збереження маркерів для майбутньої зручності при використанні тих самих маркерів.

7) Простий кнопковий інтерфейс користувача.

8) Автоматизоване визначення смуг.

9) Проста рамка, визначена користувачем.

10) Автоматично створений логарифм маркера.

11) Визначене користувачем розташування певних смуг.

12) Сумісність із функціями скріншотів проаналізованого гелю та логарифму смартфонів і планшетів для публікацій або звітів.

13) Показники відображаються на гелевому зображенні з виділеними прямокутниками та розрахованим розміром смуги.

14) Функція кадрування зображень перед аналізом.

15) Функція редагування для видалення небажаних смуг.

16) Різнокольорові коробки для фломастерів і стрічок.

17) Простий прямий доступ до Dropbox і галереї для зображень.

18) Сумісний із Sybr Green, аналізом агарозного гелю EtBr.

Переваги використання цієї програми для публікацій

1) Підвищує точність аналізу гелю замість того, щоб покладатися на наближення.

2) Додаткова вартість публікацій і звітів.

3) Корисний інструмент навчання для студентів природничих наук.

4) Спрощений аналіз, зменшення людської помилки та суб’єктивності – тепер ви можете довіряти значенням, які повідомляють слухачі та менш досвідчений персонал!

5) Аналіз на ходу за допомогою смартфона/планшета.

6) Автоматичний аналіз - немає потреби в міліметровому папері та виснажливому малюванні.

7) Додаток БЕЗКОШТОВНИЙ!

8) Програма автономна, доступ до Інтернету не потрібен (за винятком аналізу Dropbox).

Для цитування за допомогою APA використовуйте: Sim, J.Z., Nguyen, P.V., Gan, S.K.E. (2014) GelApp: DNA&Prot Gel Analyzer v1.0.

Ця програма є продуктом Лабораторії розробки антитіл і продуктів Відділу трансляційних досліджень Інституту біоінформатики Агентства науки, технологій і досліджень Сінгапуру.

Творці: пан СІМ Цзя Чжі, пан НГУЕН Пхі Ву та доктор Семюель ГАН.

(Політичний стажер) (Науковий співробітник) (Керівник групи)