Перейти до змісту
CF

compsortall for Mac

Видавництво: Paul A. Wilson
Mac Free
Завантажити v1.01 20 завантаження
Версія1.01
Видавництво Paul A. Wilson
Дата випуску25 серп. 2008 р.
Дату додано22 серп. 2004 р.
Вимоги ОСMacintosh, Mac OS X 10.3
ВимогиMac OS X 10.3
Загальна кількість завантажень20
ЦінаFree

Опис

Інструмент командного рядка для порівняння файлів даних, розділених комами, з використанням відносних відмінностей для визначення найбільш подібних конформацій. Compsortall порівнює файли даних, використовуючи відносну різницю, обчислює оцінку подібності, сортує оцінки з ядра в порядку зростання (менші значення означають більшу схожість), зберігає всі оцінки в текстовому файлі. Файли даних, створені користувачем, мають бути текстовими файлами, розділеними комами. Кожен файл представляє унікальну молекулу. Кожен рядок у файлі представляє унікальну конформацію молекули. Перший стовпець у файлі даних має бути міткою, унікальною для конформації, представленої рядком. Решта стовпців є числовими дескрипторами, такими як вимірювання простору відстані. Рядки порівнюються комбінаторно між файлами. Мітки для порівняння об’єднуються та зберігаються з балами для набору рядків. Це забезпечує спосіб ідентифікації конформацій, які спричинили задану оцінку подібності.

Майбутня робота включає:

додавання GUI інтерфейсу

опублікувати статтю про мій алгоритм моделювання 3D фармакофора

Паралельна версія з використанням MPI

Подібні програми

Альтернативи

Більше від цього видавця