| Версія | 1.01 |
|---|---|
| Видавництво | Paul A. Wilson |
| Дата випуску | 25 серп. 2008 р. |
| Дату додано | 11 серп. 2004 р. |
| Вимоги ОС | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Вимоги | Mac OS X 10.3 |
| Загальна кількість завантажень | 29 |
| Ціна | Free |
Опис
Інструмент командного рядка для порівняння файлів даних, розділених комами, з використанням відносних відмінностей для визначення найбільш подібних конформацій. Comport порівнює файли даних за допомогою відносної різниці, обчислює оцінку подібності, сортує оцінки в порядку зростання (нижчі значення означають більшу подібність), зберігає кількість низьких оцінок X.
Файли даних, створені користувачем, мають бути текстовими файлами, розділеними комами. Кожен файл представляє унікальну молекулу. Кожен рядок у файлі представляє унікальну конформацію молекули. Перший стовпець у файлі даних має бути міткою, унікальною для конформації, представленої рядком. Решта стовпців є числовими дескрипторами, такими як вимірювання простору відстані.
Рядки порівнюються комбінаторно між файлами. Мітки для порівняння об’єднуються та зберігаються з балами для набору рядків. Це забезпечує спосіб ідентифікації конформацій, які спричинили задану оцінку подібності.
Майбутня робота включає:
додавання GUI інтерфейсу
опублікувати статтю про мій алгоритм моделювання 3D фармакофора
Паралельна версія з використанням MPI